MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-5

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017227	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017227	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017227	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017227	AGG	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017227	AGG	2	6	3941	3946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017227	ATT	2	6	10270	10275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017227	T	6	6	15155	15160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017227	TA	3	6	15181	15186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017227	TA	3	6	15190	15195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017227	A	6	6	15201	15206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017227	T	6	6	15373	15378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017227	GGAAAT	2	12	15385	15396	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017227	A	6	6	15406	15411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017227	GTT	2	6	16456	16461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017227	CTAA	2	8	16502	16509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017227	ATA	2	6	16518	16523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017227	AAT	2	6	17173	17178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017227	AT	3	6	17186	17191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017227	ACA	2	6	17208	17213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017227	TTA	3	9	17307	17315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017227	AT	3	6	17320	17325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017227	A	6	6	17338	17343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017227	TCC	2	6	18855	18860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017227	TAAA	2	8	18871	18878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017227	TA	3	6	18879	18884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017227	T	6	6	18906	18911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017227	A	7	7	18926	18932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017227	T	6	6	18990	18995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017227	AGGT	2	8	19010	19017	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017227	AATC	2	8	19075	19082	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017227	A	6	6	19098	19103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017227	TAAT	2	8	19111	19118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017227	TAA	2	6	19124	19129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017227	TAA	2	6	19138	19143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017227	T	7	7	19144	19150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017227	ATTAT	2	10	19184	19193	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017227	ATT	2	6	19196	19201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017227	A	10	10	21668	21677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017227	A	7	7	21690	21696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017227	A	6	6	22821	22826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017227	T	6	6	22839	22844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017227	TAT	2	6	22849	22854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017227	TGA	2	6	22865	22870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017227	A	6	6	22879	22884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017227	ATTTT	2	10	22889	22898	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017227	T	7	7	22958	22964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017227	A	8	8	22967	22974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017227	T	6	6	23035	23040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017227	T	6	6	23075	23080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017227	TAA	2	6	23093	23098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017227	T	7	7	23105	23111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017227	T	6	6	23119	23124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017227	AT	3	6	23154	23159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017227	AATA	2	8	23160	23167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017227	ATA	2	6	23172	23177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017227	AT	3	6	23193	23198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017227	TGG	2	6	23217	23222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017227	T	9	9	23265	23273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017227	A	6	6	23297	23302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017227	TA	4	8	23317	23324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017227	AT	3	6	23328	23333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017227	A	8	8	23337	23344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017227	TAT	2	6	23350	23355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017227	AGG	2	6	23490	23495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017227	A	8	8	24842	24849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017227	AGG	2	6	24860	24865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017227	CTC	2	6	26084	26089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017227	AAGTAA	2	12	26115	26126	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017227	AT	3	6	26132	26137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017227	CAAAAA	2	12	26161	26172	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017227	AAGA	2	8	26269	26276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017227	AT	3	6	26293	26298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017227	AATTT	2	10	26313	26322	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017227	GA	3	6	26368	26373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017227	TTA	2	6	26468	26473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017227	AAC	2	6	27311	27316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017227	TAA	2	6	27322	27327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017227	TAT	2	6	27340	27345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017227	ATTA	2	8	28079	28086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017227	TTTA	2	8	28095	28102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017227	TCC	2	6	28172	28177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017227	AT	3	6	28195	28200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017227	TAA	2	6	28222	28227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017227	GTT	2	6	28238	28243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017227	AGC	2	6	28886	28891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017227	AATA	2	8	28912	28919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017227	TTA	2	6	28949	28954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017227	TTA	2	6	29003	29008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.